饲料在发酵的过程中，微生物区系平衡被打*后，益生菌在特定情况下有可能会转变为病原菌，如乳酸杆引起的临床生病。因此发酵饲料的使用应充分考虑动物、消费者以及环境等因素安全方面的问题，经过严格的科学试验确认其无害后才能推广应用。微生物发酵饲料中的大部分有益菌是活菌，而抗生具有杀菌作用，因此二者也不能同时使用。
屏障和生物屏障。微生物的代谢产物如丙酸、乳酸、抗苗肽和其他活性物质等共同组成化学屏障；微生物菌群有秩序地定植于黏膜、皮肤等表面或细胞之间形成生物屏障，这些屏障可以阻止病原微生物的定植，起着占位、争夺营养的作用。
提高机体体质功能微生物*****中的有益菌均是良好的俊，它们能刺激肠道，激发机体产生体液和细胞。可以提高畜禽水平或提高巨噬细胞的活性，增强体质功能，及时杀灭**体内的致病菌，发酵饲料价格，从而防止**的发生。
微生物发酵饲料的定义在人为可控制的条件下，以植物性农副产品为主要原料，通过微生物代谢作用，降解部分多糖、蛋白质和脂肪等大分子物质，生成有机酸、可溶性多肽等小分子物质，形成营养丰富、适口性好、活菌含量高的生物饲料或饲料原料。微生物发酵饲料的主要特征饲料具有天然发酵香味，发酵饲料，良好诱食效果，发酵饲料批发，能显著提高适口性。含有大量有益菌，**菌数量极低，不超过10cfu/g。发酵成品pH值较低，在4.5左右，含有较多乳酸和等有机酸。
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