纳滤软化水厂与石灰软化水厂的费用比较，产水能力越大，两类水厂的建设费用和运行费用越低。当产水能力达到57 000 m3/d，纳滤软化水厂的建设费用和运行费用分别可以达到仅比石灰软化高10%和15%的水平。若石灰软化后再增加其它处理单元如臭氧化以达到同纳滤软化相当的水质，或纳滤软化出水掺混部分旁路出水达到石灰软化相当的水质，纳滤软化水厂的建设费用和运行费用会比石灰软化低。纳滤处理地下水的经济性时，将纳滤出水与传统水厂出水按满足一定的水质要求进行适量混合，则可显著降低产水成本。
纳滤膜通过空间位阻和电荷效应的共同作用就可对溶液中的多肽和氨基酸。诸多研究显示在一定pH和离子强度下,膜与多肽、氨基酸离子间的相互作用程度能。利用截留分子量为2500的醋酸纤维素纳滤膜对乳清蛋白。结果表明,在某一酸度、未加的条件下,带负电的膜对正电。此外纳滤膜的高通量、低操作压力、无污染。
随着对纳滤的深入研究，目前更认同纳滤膜是具有荷电的纳米微孔结构，离子在带电微孔内进行扩散和对流传递过程时受到立体阻碍和静电排斥两方面的影响。基于这种观点， 在前人研究的成果基础上建立了静电位阻模型。根据静电位阻模型，若离子的大小、离子价数及其在膜孔中的扩散系数不同，则它透过纳滤膜的难易程度不同，从而可实现离子的选择性去除。