液相色谱仪是属于易学难用的仪器，特别讲究“正确使用”和经验。液相工作者接触多的是流动相，流动相也是造成液相色谱各种问题的主要源头。液相色谱常见的故障一是堵，二是漏。下面就这两分别展开讨论（流动相以甲1醇为例，色谱柱以C18为例） 。
为何会堵?
“堵”的表现现象就是柱压异常升高，直接原因就是流路不畅。堵塞的主要位置就是在色谱柱的前端，层析泵，主要原因就是流动相里有杂质，杂质的主要来源就是**。
色谱分离原理
液相色谱法按分离机制的不同分为液固吸附色谱法、液液分配色谱法(正相与反相)、离子交换色谱法、离子对色谱法及分子排阻色谱法。
1.液固色谱法 使用固体吸附剂，被分离组分在色谱柱上分离原理是根据固定相对组分吸附力大小不同而分离。分离过程是一个吸附-解吸附的平衡过程。常用的吸附剂为硅胶或氧化铝，粒度5~10μm。适用于分离分子量200~1000的组分，大多数用于非离子型化合物，离子型化合物易产生拖尾。常用于分离同分异构体。
2.液液色谱法 使用将特定的液态物质涂于担体表面，或化学键合于担体表面而形成的固定相，分离原理是根据被分离的组分在流动相和固定相中溶解度不同而分离。分离过程是一个分配平衡过程。
涂布式固定相应具有良好的惰性;流动相必须预先用固定相饱和，以减少固定相从担体表面流失;温度的变化和不同批号流动相的区别常引起柱子的变化;另外在流动相中存在的固定相也使样品的分离和收集复杂化。由于涂布式固定相很难避免固定液流失，现在已很少采用。现在多采用的是化学键合固定相，如C18、C8、氨基柱、基柱和柱。
如何预防液相色谱仪液相泵的故障： 要保持泵的良好操作性能，必须维护系统的清洁，保证溶剂和**的质量，对流动相进行过滤和脱气.下面列出预防泵故障的几项措施： 1、用高质量**和HPLC级溶剂； 2、过滤流动相和溶剂； 3、脱气； 4、每天开始使用时放空排气，工作结束后从泵中洗去缓冲液； 5、不让水或腐蚀性溶剂滞留泵中； 6、定期更换垫圈； 7、需要时加润滑油； 8、查阅有关泵操作手册中的其它建议。 处于良好操作状态的泵，应该能使色谱图上的基线平稳；保留时间的重复性好。在等度洗脱时压力波动小于2%。梯度洗脱时压力变化应是缓慢和平稳的。 为了使故障发生后尽除，平时应常备密封、单向阀、泵头装置、各式接头、**丝等部件，以及更换工具。
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