堆肥是一种有机肥料，它是由各种各样的桔茎、叶子、草、动植物残馀、人和动物粪便、少量土壤混合而成。堆肥是用与堆肥相同的材料制成的，在淹水条件下进行发酵。粪便是指由猪、牛、马、羊、鸡、鸭等制成的粪便。沼气肥料是沼气的副产品，它是沼气在密封的沼气罐中分解有机物而产生的，包括沼气液体和残渣。
绿肥被栽培的或的绿色植物用作肥料。如绿豆、蚕豆、甜三叶草、大头菜、大头菜、紫花苜蓿、青菜等。非豆科绿肥包括黑麦草、大头菜、秋葵种子、河红、水葫芦、水花生等。
生物有机肥与生物***肥料的区别:
1)生物有机肥价格低廉，每吨约1000元;生物***肥料很贵，湖南有机肥，每吨要花几万元。
2)生物有机肥含有功能性***和有机质，可以改善土壤，促进土壤固定营养物质的释放;生物***肥料只含有功能性***，有机肥代加工，通过功能性***促进土壤固定肥料的使用。
3)生物有机肥的有机质是功能性***的生存环境，在土壤中施用容易生存。生物***肥料的功能菌群可能不适用于某些土壤环境。
如何调节(根际)土壤微生物菌群涉及到使用何种肥料的问题。肥料一方面是将现有良好的微生物在土壤中，使它生长快，另一方面，缺乏良好的土壤微生物，试着介绍，给他们“费”，“住房”，有机肥加工，给他们解决问题的”妻子工作孩子上学”(微生物)，这就需要通过大量筛选外国微生物资源，获得更好的，然后研究外源微生物的生理(营养特征)生态(环境)土壤条件，使它们进入一个陌生的环境而不孤独，让它们进入土壤可以像鸭子到水一样，全身心投入到自己的工作中，这就是我们调节土壤微生物菌群的方式。
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