转1基因技术是伴随着对生物体的认识才发展起来的技术，在生物本身还未完完全全地认识的情况下进行基因层次的修饰，出现预料不到的结果和不确定性与不能解释的情况是肯定的。其造成各种不确定性的来源包括: 基因从原有机体转人宿主有机体中，两者的生理的差异对终产物影响而导致的安全性问题。
转移的基因结构的稳定性。确保经遗传修改的生物已获得要表达良性性状所需的zui小DNA部分片段，由于DNA结构的稳定有助于性状表达的稳定，额外的DNA部分片段可能导致基因沉默或终产物的表达不稳定，甚至产生不需要的性状或有毒物质。 基因插人受体基因组的位置和拷贝数的不确定性。无论是农杆1菌介导法、基因法、花粉管通道法、PEG介导电1击法等，质粒在进人宿主基因组的位置与数量均是不确定的，目的基因的表达量难以预料，同一批的转1基因材料可能存在差异。
转1基因载体引起的不确定性。食用具抗生1素耐药性的选择性标识基因可能会影响人的抗病能力。Netherwood等分别让7个肠道炎的和12个健康的志愿者食用添加转1基因大豆(EPSPS)的汉堡和豆奶昔，虽然在12个健康个体的粪便中没有发现转1基因，但在7个肠道炎志愿者的xiao肠中都发现了转1基因，其中的3个出现有转1基因向肠道微生物转移的现象，即有可能抗生1素标记会转移到肠道微生物上。
基因导入细胞常用方法
转染
重组的噬菌体DNA也可象质粒DNA的方式进入宿主菌，即宿主菌先经过CaCl2，电穿孔等处理成感受态细菌再接受DNA，逆转录病毒滴度测定，进入感受态细菌的噬菌体DNA可以同样copy和繁殖，这种方式称为转染（transfection）。M13噬菌体DNA导入大肠杆1菌就常用转染的方法。重组DNA进入宿主细胞也常用转染方式。zui经典的是1973年建立的磷酸钙法，其利用的基本现象是：DNA如以磷酸钙-DNA共沉淀物形式出现时，培养细胞摄取DNA的效率会显著提高。用电穿孔法处理培养的哺乳类细胞也能提高细胞摄取DNA能力，但所用外加电场的强度、电脉冲的长度等条件与处理细菌者都很不相同。用人工脂质膜包裹DNA，形成的脂质体可以通过与细胞膜融合而将DNA导入细胞，方法简单而有效，但缺点是有细胞毒性和血1清的不亲和性，近年来人们发现了一种更为有效的转染试剂－阳离子聚合物，其克服了脂质体转染试剂细胞毒性大，在体内易被血1清清除等缺点，具有转染效率1高，操作简单而日益受到重视。
基因是控制生物性状的基本遗传单位。19世纪60年代，奥地利遗传学家格雷戈尔·孟德尔就提出了生物的性状是由遗传因子控制的观点，但这仅仅是一种逻辑推理。20世纪初期，遗传学家摩尔根通过果蝇的遗传实验，认识到基因存在于染色体上，并且在染色体上是呈线性排列，从而得出了染色体是基因载体的结论。1909年丹麦遗传学家约翰逊（W. Johansen，1859～1927）在《精密遗传学原理》一书中正式提出“基因”概念。
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