一般而言，生物方法是去除废水中有机物经济有效的方法，颗粒活性污泥，特别是对废水中BOD含量较高的有机废水更为适宜。利用微生物生命过程中的代谢活动，将有机废弃物分解为简单无机物从而去除有机物污染的过程被称之为废水的生物处理。根据代谢过程中对氧的需求情况，微生物可以分为好氧微生物、厌氧微生物和介于二者之间的兼性微生物，因此，相应的污水处理工艺也可以分为三大类。
应对污染源可能存在的毒性***物进行排查，并建立污染物排放源和污水站之间的事故排放通报机制，和潜在的毒性物质日常监测机制，是防止此类厌氧反应器酸化事故的有效应对措施。对于某些缺乏诸如N、P或其他微量元素的废水，投加足量的营养盐非常必要。因为厌氧污泥中无论是产甲1烷菌还是水解酸化菌，都需要这些元素进行新陈代谢以及合成细胞物质。
厌氧处理系统规模灵活，可大可小，设备简单，易于制作，无特别昂贵的设备。它的这一生物特性为其间断的或季节性的运行提供了有利条件，厌氧污泥因此可以作为新建厌氧处理装臵的种泥出售。目前正在运行的单座厌氧处理装臵的规模从几十立方米到几万立方米不等。完全混合厌氧反应器（CSTR）传统的完全混合厌氧反应器（CSTR）是借助消化池内厌氧活性污泥来净化有机污染物。
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