反冲洗对于防止大颗粒对某些型式反渗透膜件的堵塞是有效的。但不是所有的污染都可通过简单的反冲洗就能清除掉，还需要有周期的化学清洗。化学清洗除需增加药剂和人工费用外，还有污染问题，所以也不可过于频繁，每月不应超过1-2次，每次清洗时间约1-2h。化学清洗系统通常包括一台化学混合箱和与之相配的泵、混合器、加热器等。化学清洗常是根据运行经验来决定(可以根据每列设备压降读数与运行时间的关系曲线，或是依据产水量、淡水水质和膜的压降等)。
实验室标准用水有一级水、二级水、三级水三种水质，但大多数实验室用两种水质即可，一是三级水，如蒸馏水，用于玻璃器皿的清洗等；二是一级水，主要用于化学分析或者液相、原子吸收等精密仪器分析。客户应根据实际水质需求来选用超纯水机的档次。 以自来水为水源的超纯水机都具有两个(两种水质)的出水口，一是纯水，即三级水；二是一级水，即超纯水（严格意义上讲一级水的电阻大于10兆欧，而超纯水的电阻大于18兆欧）多数客户对自己的水质需求并不清楚，***相关部门虽然有各种水质标准，但是对具体的实验项目或仪器分析用水没有完整的量化指标，往往在选购好超纯水机之后才发现水质不达标。根据经验，可以遵循以下几个选购原则，相对应即可。
目前，我国电子工业部把工业超纯水水质技术分为五个行业标准(GB/T 11446)，分别为18MΩ.cm、15MΩ.cm、10MΩ.cm、0.5MΩ.cm，以区分不同水质。制备超纯水的办法一般选用反渗透设备，RO纯水系统，去离子或电去离子(EDI)等工艺。在水质要求达10MΩ.cm以上，一般选用不同的工艺进行组合调配的办法来制取，例如选用反渗透加去离子，反渗透加EDI等。
为满足用户需要，达到符合标准的水质，尽可能地减少各级的污染，延长设备的使用寿命、降低操作人员的维护工作量;在工艺设计上，取达***自来水标准的水为源水，经过预处理系统、反渗透系统、离子交换混床(EDI电除盐系统)等系统，根据不同用户对纯水的要求不一，以排列组合的方式，生产出一套套量身订制的纯水处理设备。
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