不同特性的废水进入反应器后对pH值的影响也不同 ，例如含碳水化合物的废水会引起pH值的降低 ，而含大量蛋白质和氨基酸的废水则会造成pH值上升。因而 ，进液时废水可有不同的pH值 ，关键是保证进液后pH值的稳定 ，使废水有一定的缓冲能力 ，防止酸积累对甲1烷菌产生毒性影响。在操作过程中出水回流不仅在反应器启动阶段提供反应器一定的水力负荷 ，且由于出水碱度高于进水碱度 ，可增加废水的缓冲能力 ，减少化学物质的添加。
结果表明:厌氧中温(35℃左右)稳定运行时，颗粒污泥的沉速较大，在低温或微氧时，颗粒污泥的 沉速相对较低，但都能维持在15 m/h以上，不会被冲出反应器而造成污泥的流失。低温时大颗粒污泥所占重量百分比在逐渐增加，微氧使得颗粒污泥粒径分配更加均匀。低温时，颗粒污泥的产甲1烷活性明显降低，降幅为55.5%;但微量氧的加入并没有使EGSB反应器内颗粒污泥的产甲1烷活性降低，反而提高了10%。
培养厌氧颗粒污泥的自制反应器进水为养猪废水，进行不同惰性载体对厌氧颗粒污泥形成影响的对比实验。结果表明，添加大孔型阳离子交换树脂的反应器培养时间为39d，COD去除率达到80%，活性污泥颗粒，并出现粒径为2.50~3.00mm的大颗粒污泥，产甲1烷量为9.75mL CH4·(gVSS·d)-1，与添加聚合铝和粉煤灰的反应器相比，产甲1烷菌活性显著强;添加惰性载体与未添加载体反应器相比，培养时间缩短20%~45%，厌氧颗粒污泥活性相差14.00%±0.10%。
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