RNA pull down 检测
RNA pull down:RNA沉淀检测,是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验方法之一。使用体外转录将RNA进行生物素标记,并与细胞蛋白裂解液孵育,形成RNA-蛋白复合物。复合物通过磁珠结合后分离,复合物纯化洗脱后通过Western blot验证检测特性的蛋白。若筛选可能结合的蛋白通过质谱实验进行检测筛选。
RNA提取及注意事项
研究***的表达和调控时,需要从***或细胞中分离纯化RNA。RNA质量的高低经常影响RT-PCR、cDNA库构建和Northern Blot等分子生物学实验的成败。
主要***
Trizol是一种新型总RNA抽提***,内含异***胍等物质,能迅速破碎细胞,***细胞释放出的核酸酶。
1.
Trizol***含有,具***性和刺激性,注重操作。
2.
RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。
3. 细胞裂解必需充分且操作迅速。裂解不完全会降低后得率,因为一部分RNA会残留在未裂解的细胞中。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔***和骨除外)。在清洗和裂解细胞时在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。
4. 酵母和一些***由于细胞壁的特别结构,可以加入Trizol***同时加入无RNase的玻璃珠并剧烈振荡,dna检测,使细胞裂解充分。
2-8℃ 避光保存一年。
注意事项
1. 为了避免蛋白质变性,不要对样品剧烈搅动和反复冻融。
2. 缓冲溶液成分尽量模拟细胞内环。。
3. 为了避免蛋白质的氧化,将 0.1~1 mmol/LDTT(二硫苏糖醇)(或 β-巯)加入到缓冲溶液中。
4. 为了避免***对目标蛋白的***,将 1~10 mmol/LEDTA 金属螯合剂加入。
5. 为了避免微生物生长,绍兴pcr,使用灭菌溶液。在纯化任何一种蛋白质的时候,***检测多少钱,均必须时刻对它的稳定性注意维护,使它的活性得到保护,需要牢记如下一些通用的注意事项。
6. 尽可能置于冰上或者在冷库内进行操作。
7. 蛋白浓度不要太稀。
8. 除非是进行聚焦层。否则 pH 需要合适,防止所使用的缓冲溶液 pH 与 pI 相同,使蛋白质的沉淀得以避免。
9. 使用蛋白酶,避免蛋白酶对目标蛋白的降解;在纯化细胞中的蛋白质时,将 DNA 酶加入来使得 DNA 降解,避免 DNA 对蛋白的污染。
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