在基片上制备微阵列(即高密度地固定生物分子于基片上)的过程是微阵列芯片的关键技术，羟基化表面处理，发展非常迅速，相继出现了原位合成、预合成后钢针按触式点样、预合成后毛细管接触式点样、预合成后微泵喷涂等微阵列制备方法。这些方法在提高点样质量和点样效率、降低芯片成本等方面各有长有短。国际上一些大公司和研究机构，北京表面羟基化，如BioRobotics公司、Cartesian公司、TeleChem Interna-tional Inc. Standford大学和生物芯片北京***工程研究中心等，都在进行微阵列芯片的制备方法及制备系统的研发。 BioRobotics 公司开发的芯片制备系统和TeleChem International Inc 的微阵列制备工作头为各研究机构所普遍采用。
新兴的微阵列芯片技术是分子生物学技术和计算机技术高度有机结合的产物，体积小、实验效能高 ， 可以节约人力、 物力和时间， 是对传统分子生物学研究方法和临床检测方法的重要补充 。在微阵列技术的实际应应用中 ，数据分析具有举足轻重的作用 ， 目前还没有对现有的各种统计学模型进行过综合评价 。这一缺陷亟待弥补 。虽然人类***组草图已经绘制完成 ， 但整个***组研究才刚刚开始 。此时如果没有把研究所产生的海量数据进行有效的管理 ， 将对后续研究的深入和应用造成严重的影响 。从现有资料来看， 应用微阵列芯片技术所产生的数据还没有统一的管理方案， 这些研究的结果仍然分散地保存在不同的数据 库中，这些数据库也处在探索阶段 。
目前， 在***研究中 ， 数据分析方法在总体上分为两大类:无监控集簇分析和有监控集簇分析。前者比较单纯的从数学角度按照***表达的相似性将***分组 ，如何表面羟基化， 这有助于发现新的目的***或提供新的***信息 ， 如新的分型 、 影响预后的因素等。后者需要结合现有的知识进行分析， 适用于***归类。这对于传统诊断手段是一个有益的补充。
另外，硅片表面羟基化， 在目前进行的许多微阵列芯片研究中，每次研究的***数目很大 ， 而参与实验的样本量较少。这一现象不利于得到稳定的和具有良好可重复性的实验结果。
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