若从蛋白质氨基酸来分析，扁桃仁的限制氨基酸是赖氨酸，含硫氨基酸也较低，但是精氨酸、色氨酸特别丰富，亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸含量也很高。它的氨基酸化学分（AAS）略高于核桃，但明显低于动物性食品。这说明，用扁桃仁来替代肉蛋奶等赖氨酸丰富的食品并不可取。但是，由于精氨酸对于***的血管扩张有重要意义，而亮氨酸等支链氨基酸对于***肌肉的合成也有促进作用，在不缺乏动物性食品的情况下，扁桃仁的氨基酸构成对于现代人***来说并非缺点，甚至具有优势。
从微量营养素来看，国产扁桃仁的***B2和***E含量特别丰富，高于花生、核桃等坚果。对喀什地区所产扁桃仁测定表明，其中钾、钙、镁含量十分丰富，铁和锌元素的含量也很高（刘金荣等，2002）。维吾尔族认为扁桃仁具有强壮作用，据说60%的维吾尔民族药的配方中要用到扁桃仁，很可能与其氨基酸构成特点和微量元素含量有关。
不同口味的扁桃仁气味存在细微的区别，而市场上卖的扁桃仁简单来分有2种，一种是经过机器炒制加工的，另一种是无加工的天然扁桃仁，也就是原味。我们可以拿起一颗凑近鼻子仔细闻一闻，天然原味的闻起来味道不重，有股淡淡的坚果油清香和木质香气。如果能闻到发霉的酸腐味，或者坚果油气味过浓，这则说明扁桃仁是存放了很久甚至已经发霉了的，这种千万不要食用和购买。而炒制好的优质扁桃仁闻起来有种淡淡的木质清香和咸香，不存在任何杂味。如果闻到有焦味、糊味，则代表了炒制火候过大，这样的扁桃仁口感上会有一定的欠缺。
有些***体质多吃扁桃仁会出现***反应，原味扁桃仁厂家，这是由于扁桃仁中可能含有一些特殊的蛋白，体质敏感的人对稀有的蛋白比较敏感，再加上过多的食用就更可能导致***，产生皮肤搔痒、咽喉水肿等症状。解决措施：一般***不用担心，它会自行缓解。严重的话，可在医生指导下，口服防风通圣丸水丸之类的药。
扁桃仁不仅香美可口，味道甘甜，而且营养价值很高。有关扁桃仁的营养价值，已经有了很多的商业宣传，但我国国产扁桃仁的营养品质，人们恐怕还所知不多。
1999年对我国新疆所采扁桃仁进行的测定表明，国产扁桃仁（扁桃仁）的粗蛋白含量为28%，脂肪含量为55%，而且脂肪当中，单不饱和脂肪酸比例高达71%，堪与橄榄油相媲美。其亚油酸含量为20%，不饱和脂肪酸比例占92%。
也就是说，从脂肪酸比例来说，扁桃仁几乎和橄榄油相当，而它的蛋白质和膳食纤维含量远远高于橄榄油，它的优势是其他坚果难以比拟的。
