在发酵过程中，天然生物有机菌肥，对温度的控制非常重要。温度过低，达不到腐熟的标准；温度过高，堆肥的养分容易损失。堆肥内的温度是从外表向内30厘米以里为准。因此，测量温度用的温度计，它的金属杆要长于30厘米，在测量时，要插入堆肥内30厘米以上，才能正确的反映堆肥的发酵温度。
发酵温度和时间的要求：
堆肥结束后，鸡粪就进入第壹次发酵阶段。它会自动升温到55℃以上，维持5到7天，这时就能杀大部分寄生卵和***菌，达到无害化处理标准。过3天左右翻一次堆，这有利于透气、散热、腐熟均匀。
发酵7-10天后，温度自然降到50℃以下，由于在第壹次发酵过程中有些jun种会因高温失去活性，需要第二次发酵时。再次加入5-8千克的jun种混合物，搅拌均匀。这时次将水分控制在50%左右。如抓一把鸡粪在手里，握紧成团，手心潮湿，指缝间无水渗出，说明水分合适。
第二次发酵的温度要控制在50℃以下，经过10-20天，堆肥内温度就下降到40℃以下了，这就达到了腐熟标准。
?有机肥有机肥真假鉴别
1.泡水法
取一水杯，天然生物有机菌肥的使用，把有机肥样品泡在水里，然后用手把泡在水里的有机肥碾碎，搅一下能直观的看出有机肥的原料；再放置一段时间，如果有机肥与水短时间内分层的话说明有机肥比重大，含土较多。
2.闻味法
仔细闻一下肥的味道看是否有氨味，粪便味，淤泥味，好的有机肥应该是一种彻底腐熟的味道。
3.手捻法
取有机肥用大拇指和食指来回碾压，如果有硌手的感觉，则里面有沙粒或其他杂质。
4.jun种测试法
取一水杯把有机肥放在里面，撒少许水（注意不要泡水，潮湿就行），放在温暖适宜的地方，好的有机肥会抱团长出白色菌丝，掰开有机肥颗粒会看到里面也有白色菌丝。
5.盆栽测试法
取一盆花，抓一大把有机肥直接撒在花的根茎部，浇上水，好的有机肥会逐渐长出白色菌丝，促进植株生长，质量不合格的有机肥会熏苗，植株逐渐萎靡，直至死。
6.对比试验法
选择好有机肥后在种植作物时，留出一部分不施用该有机肥，观察植株的表现，好的有机肥在长势、产量、品质上都会有明显的效果。
生物菌肥内含有特定的体微生物，通过其生命活动促进植物营养元素的供应量吸收，有的还能释放生长素并******微生物的形成。其作用机理有改善土壤的理化特性，提供植物所需的营养元素，天然生物有机菌肥技术，改善植物对营养的吸收，使叶绿素含量增加，减少呼吸作用；微生物在正常的生长中释放素，刺激作物根系的生长，使作物积累营养成分，***终使产量提高；还可以增强植物抗逆性，***病虫害发生，降低产量损失。
生物菌肥的分类
①按jun种
枯草芽孢杆jun：增加作物抗逆性、固氮。
巨大芽孢杆jun：解磷(磷***)，具有很好的降解土壤中有机磷的***。
胶冻样芽孢杆jun：解钾，释放出可溶磷钾元素及钙、硫、镁、铁、锌、钼、锰等中微量元素。
地衣芽孢杆jun：抗病、杀灭***菌。
苏云金芽孢杆jun：杀虫(包括根结线虫)，对鳞翅目等节肢动物有特异性的杀活性。
侧孢芽孢杆jun：促根、杀菌及降解***。
胶质芽孢杆jun：有溶磷、释钾和固氮功能，分泌多种酶，增强作物对一些病害的抵抗力。
泾阳链霉菌：具有增强土壤肥力、刺激作物生长的能力。
菌根***：扩大根系吸收面，增加对原根毛吸收范围外的元素(特别是磷)的吸收能力。
棕色固氮菌：固定空气中的游离氮，增产。
光合菌群：是肥沃土壤和促进动植物生长的主力队。
凝结芽孢杆jun：可降低环境中的氨气、硫画氢等***气体。提高果实中氨基酸的含量。
米曲霉：使秸秆中的有机质成为植物生长所需的营养，提高土壤有机质，改善土壤结构。
淡紫拟青霉：对多种线虫都有防治效能，是防治根结线虫***有前途的生防制剂。
②按功能
有固氮作用的菌肥：包括根瘤菌、固氮菌、固氮蓝藻等。
分解土壤有机物的菌肥：包括有机磷***和复合***等。
分解土壤中难溶性矿物的菌肥：包括硅酸盐***、无机磷***等。
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