层析根据固定相与溶质（试料）间亲和力的差异分为吸附型、分配型、离子交换型（离子交换层析）等三种类型。但这并不是很严格的，有时常见到其中间类型。如果在支持物上涂上一层高碳原子的疏水性强的烷烃类，洗脱液用极性强的溶剂，如和水的混合物。此外，近来也应用亲和层析，即将与基质类似的化合物（通常为共价键）结合到固定相上，再利用其特异的亲和性沉淀与其对应的特定的酶或蛋白质。
按层析的机理划分：吸附层析、分配层析、离子交换层析、凝胶过滤层析、亲和层析等。吸附层析：利用吸附剂表面对不同组分吸附性能的差异，达到分离鉴定的目的。分配层析：利用不同组分在流动相和固定相之间的分配系数不同，使之分离。离子交换层析：利用不同组分对离子交换剂亲和力的不同。因此选择层析固定相支持物的粒度、均匀度等物理性能，流动相的层析系统和温度等都是做好层析的关键。凝胶层析：利用某些凝胶对于不同分子大小的组分阻滞作用的不同。
超高1效液相色谱法的原理与高1效液相色谱法基本相同，所改变的地方有以下几点：小颗粒、微粒固定相的出现。 高1效液相色谱的色谱柱，例如常见的十八***硅胶键合柱，它的粒径是5um，而超高1效液相色谱的色谱柱，会达到3.5um，甚至1.7um。这样的孔径更加利于物质分离（2）超高压输液泵的使用。由于使用的色谱柱粒径减小，使用时所产生的压力也自然成倍增大。故液相色谱的输液泵也相应改变成超高压的输液泵。（3）高速采样速度的灵敏检测器。（4）使用低扩散、低交叉污染自动进样器。层析根据固定相与溶质（试料）间亲和力的差异分为吸附型、分配型、离子交换型（离子交换层析）等三种类型。配备了针内进样探头和压力辅助进样技术；（5）仪器整体系统优化设计。色谱工作站配备了多种软件平台，实现超高1效液相分析方法与高1效液相分析方法的自动转换。
