生物有机肥富含有益微生物菌群一般生物肥都含有酵母菌、乳酸菌、纤维素分解菌等有益微生物，而加有功能菌的生物有机肥还可能含有固氮菌、钾***、磷***、光合***及假单胞菌等一些根际促生菌（PGPR）。这些菌除了具有产生大量活性物质的能力外，生物有机肥，有的还具有固氮、解磷、解钾的能力，有的具有***植物根际病原菌的能力，有的则具有改善土壤微生态环境的能力。
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生物有机肥中的枯草芽孢等有益微生物利用土壤中的有机质，产生的次级代谢物中含有大量的促生长类物质，如：生长素能促进植物伸长生长，生物有机肥哪家好，脱落酸能促进果实成熟，生物有机肥，赤能促进开花坐果，增加开花数、保果率等。在多种促生长类物质的调节下，可以使作物产量提高、品质提升，达到增产增收可促进土壤有益微生物繁殖，改善土壤的理化性质和生物活性。
过磷酸钙和钙镁磷肥直接施入泥土，容易同泥土中的铁、铝、钙等元素联结，生成难溶性的磷酸物而被固定，造成有效养分丧失。若与有机肥混杂施用，不仅可减少与泥土接触面，减少泥土与化肥的固定机会，而且可使磷肥中那些难溶性的磷转化成作物能利用的有效磷，提高磷肥的肥效。4、改良泥土结构，增进延续增产。长期单施化肥会被损坏泥土的团粒结构，造成泥土粘重板结，下降耕作性能和供肥性能。有机肥含有丰盛的有机质，可活化蓬松泥土，下降容量；可改良泥土的水、肥、气、热等理化性状；调节酸碱度。二者混用，既可提高产量，生物有机肥哪个厂家好，又可增进农业的可延续性发展。5、减少用量，降低污染。有机肥和化肥混合搭配，可以减少化肥施用量30%—50%，一方面从化肥使用量减少对土地污染。另一方面则是因部分有机肥可以降解土壤中化肥残留。6、增进微生物活动，增长泥土养分。有机肥是微生物生活的能源，化肥是微生物生长的无机营养，二者混用增进微生物活动，进而增进有机肥的分解，产生大批二氧化碳和有机酸，有助于泥土中难溶性养分溶解，供给作物吸收。
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