耐根穿刺防水卷材防水层是通过卷材在施工现场搭接形成整体防水层的，因此搭接缝施工质量是卷材防水层成败的关键。
我国卷材防水层的接缝均要求采用搭接的形式，因此足够的接缝宽度是保证接缝质量的基础，必须严格按有关规范的要求执行。
高聚物改性沥青热熔卷材在搭接缝施工时应充分加热，及时进行排气、辊压，使缝口有沥青胶溢出，并及时刮抹封口。
合成高分子卷材的搭接缝应采用卷材生产厂家配套的专用接缝胶粘剂粘结，粘结剂质量应符合有关规范的要求。施工时先将搭接的卷材翻起并临时固定。无论是金属胎耐根穿刺防水卷材还是化学阻根沥青防水卷材，生产成本的增加以及生产工序的繁琐必然会影响到其价格，耐根穿刺防水卷材的价格比一般SBS防水卷材要高也就可以理解了。将卷材接缝胶粘剂用刷子均匀涂刷在上下层卷材的粘结面，待手指触胶不粘手时，再用手一边压合，一边由内向外驱除空气。粘合平服后，用手压辊，按顺序认真辊压一遍。
缝粘结完成后，在搭接的卷材边口用材性相容的密封材料封严，宽度不应小于10mm。或采用宽度25mm左右的密封胶带封口。