饲料发霉的原因：饲料在生产过程中由于原料自身水分过高、烘干或冷却系统的故障造成成品平均水分超标从而引发饲料早期霉变的现象一般比较少，因为成品的平均水分通过检测后如果超标会作处理，不会流入市场。但是在小批量生产过程中，由于制粒调质温度还没有调整到正常就已制粒完毕；颗粒离开环模时温度低，冷却器内的温度也低，饲料中水分子的活性弱，不容易散发。再加上冷却器中料层薄，空气流动的阻力小流量大，饲料在冷却时温度很快降到室温，但水分没有散发出来，造成水分超标。
发酵饲料的原料很多，按来源可分为：饼粕类，粮食加工厂的副产品类，微生物发酵加工厂的下脚料类，菌菇生产的基料，果蔬加工厂的下脚料类，植物的根、茎、叶类，畜禽屠宰场的下脚料类，水产品加工厂的下脚料类，薯渣类等。随着发酵饲料技术的日渐成熟及工艺设备的不断完善，更多的自然界产生的有机物及更多的加工副产物将成为发酵饲料的原料，利用率得到进一步的提高。
发酵饲料对肠道黏膜反应的作用
肠上皮细胞在黏膜反应的启动中起着重要作用，因为它们是抵御病原体和到达肠腔的***物质的一道防线。肠粘膜上皮细胞的功能完整性取决于粘液层、细胞间紧密连接、上皮细胞和宿主适应性反应的协调调节。覆盖胃肠道的粘液层是宿主防御的前线，主要是由于肠道杯状细胞的分泌产物。不同黏膜结构共同保障肠道功能的发挥。仔猪断奶时饮食和环境等的变化会促进肠道炎，发炎的肠道也为肠菌科的扩张提供了有利的环境。
