微生物菌剂施用时间一般为清晨或者阴天。微生物菌剂中的芽孢不能在阳光下直射，会使其繁殖、代谢等活动受到影响，甚至会是去活性，一定要避免在炎热高温的天气使用。2.微生物菌剂不应该长期放置，应该随用随买；使用前应该存放阴凉干燥、通风处，避免受热、受潮以及阳光直射；肥料开口后应一次用完，微生物菌剂哪家好，否则会导致其他菌进入，污染肥料中的菌。3.微生物菌剂不能随意混合化肥施用。虽然菌可以与化肥、有机肥等混合施用，但是这并不意味着可以随意混合。当化肥中氮磷钾等元素的总含量超过7%时就会在很大程度上***菌的活性。所以化肥与菌肥混用时，我们建议随用随混。
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微生物菌肥的优势：有效预防农作物生长过程中的多种***病害。
在发酵过程中能产生多种抑菌物质，如乳酸、四羟基乳酸、3-乳酸、乳酸菌素等，这些物质可以有效***农作物病原菌；可以诱导作物抗性的提高，微生物菌剂价格，诱导作物植保酶：PAL（丙氨酸解氨酶）、POD（过氧化物酶）、PPO（多酚氧化酶）。这些酶的可以促进植物一些重要次生物质的合成，微生物菌剂有哪几种，如木质素、异黄酮植保素、对病原菌***的醌类物质。从而显著能增强植物的抗病能力。
生物菌肥的群体携连作用，微生物菌剂，能极大的改变土壤性质和土壤环境，可改良土壤板结和土地肥力，帮助农作物吸收土壤里有机肥或无机肥的利用率，达到合理用肥和节省肥料目的，能分解土壤中残留的，使其还原于状态。生物菌肥不仅有固氮、解磷、解钾功能，还能调节土壤酸、碱度的平衡，促进土壤团粒化和保水、保墒、透气性能，增强作物抗病、抗虫能力。其生物菌群分泌合成的有机酸、生物酶、活性素等可直接促进植物生长，充分发挥了植物在良性状态中的增产潜力。因此，必须掌握好生物菌肥的性能和使用方法。
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