研究结果表明，施用生物有机肥后，果园土壤容重变小，土壤孔隙度增大，增加了土壤微生物数量，土壤透气性得到改善，有机质含量明显提高，土壤供氮和供磷能力增强，土壤酸碱性得到改善，有利于土壤中养分的释放。在盆栽葡萄上的研究结果表明，施用生物有机肥后，盆栽葡萄土壤中放设菌和***等有益菌的数量明显增加，其中放设菌含量达到7.6×108。
在农业的部获得登记的生物有机肥生产企业，基本上以从事微生物肥料生产为主，在发酵生产工艺上，多采用槽式堆置发酵法，还有其他的发酵方法，如：平地堆置发酵法、发酵槽发酵法、密封仓式发酵法等在生产中也得到了应用。在发酵腐熟过程中物料的水分、碳氮比、温度等的调节及腐熟剂的使用是生产工艺的关键，特别是菌剂的应用直接影响着物料发酵的周期及腐熟程度。经过腐熟的物料基本实现了产品的无害化，从而也有利于后处理过程中所加入功能菌的存活。
微生物菌肥还要看活菌数量是否符合***规定，***规定生物菌剂有效活菌数≥2亿/克，颗粒状的≥1亿/克，符合生物肥料和生物有机肥的有效活菌数≥2000万/克。切记不合格的生物菌肥不要购买使用。生物菌肥与经过充分腐熟的有机肥混合使用，其效果要远好于单独施用有机肥和生物菌肥。生物菌肥避免开袋后长期不用，要注意密封储存以免菌的种流失。开袋后长期不用，其他***就可能***袋内，使肥料中的微生物菌群的发生改变，影响其使用效果。
有机肥：主要来源于植物和（或）动物，施于土壤以提供植物营养为其主要功用的含碳物料。生物有机肥：是指特定功用微生物与主要以动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处置、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。特性不同、有机肥：经生物物质、动植物废弃物、植物残体加工而来，消弭了其中的******物质，富含大量有益物质。包括：多种有机酸、肽类以及包括氮、磷、钾在内的丰厚的营养元素。不只能为农作物提供营养，而且肥效长。
