发酵饲料按照比例添加到全价料中，带来的非常直观的效益主要体现在：降低70%的用药成本，也就是说减少了至少70%的***发生；提高饲料利用率15%以上，尤其是过料现象，过了浪费了非常多的一部分的玉米豆粕，发酵产品提高了饲料的利用率；养殖环境质量提升了，应激减少，成活率大大提升。综合计算，可以提升至少10%的经济效益。
生产中常用的益生菌分为三类：一类是乳酸菌。它是指以乳酸为主要产物的革兰氏阳性菌。按其代谢模式可分为双歧、同型发酵乳酸菌、兼性异型发酵乳酸菌以及专性异型发酵乳酸菌。应用类型有乳酸双歧、干酪乳、发酵乳、植物乳、罗伊氏乳。第二类是芽孢。芽孢是革兰氏阳性菌，能形成孢子，是传统发酵豆制品的重要菌株，能分泌多种水解酶，包括多糖酶、蛋白酶及核酸酶,能有效利用非淀粉多糖和寡糖,有效降解大豆等饲料原料中的抗营养因子。生产中应用的主要为枯草芽孢和地衣芽孢。第三类为酵母菌。酵母菌属兼性好氧菌，在好氧条件下进行好氧呼吸能将有机物完全氧化成二氧化碳、水，而在缺氧条件下将糖发酵成乙醇。酵母菌可产生氧化还原酶、脂肪酶蛋白酶、内源糖苷酶、木聚糖酶、内源葡聚糖酶、脱氢酶、脱羧酶、磷酸酶等。
由于各种微生物饲料的组合以及饲喂方法的不同，要针对不同的动物选用不同种类的微生物发酵饲料，养殖企业在选择微生物发酵饲料时应充分考虑动物种类，生理阶段，饲养条件和使用目的等因素，来确保每类产品都有明确的使用对象。
菌的搭配尤为关键，不同的动物肠道必须要搭配不同的才能更有效的让益生菌在动物体内发挥更有效的作用。