无土栽培还可以避免土壤连作障碍。常规土壤栽培中，特别是在设施栽培中，多年栽培同一种作物，土壤中往往会积累大量离子、土传病害等对植株***的物质，造成土壤养分平衡，发生连作障碍。耗工费力的“客土”方法虽能够解决连作障碍，但生产成本过大。而无土栽培，特别是采用水培，则从根本上解决了此问题。无土栽培还能够从根本上杜绝土传病害。
无土栽培还能够从根本上杜绝土传病害。无土栽培使作物彻底脱离了土壤环境，因而也就摆脱了土地的约束。耕地被认为是有限的、宝贵的、又是不再生的自然资源，尤其对一些耕地缺乏的地区和***，无土栽培就更有特殊意义。无土栽培进入生产领域后，地球上许多沙漠、荒原或难以耕种的地区，都可采用无土栽培方法加以利用。以色列作为一个异常缺水的沙漠***，却有着好的园艺业，就是无土栽培和设施园艺大规模发展的结果。
无土栽培的产量都比土壤栽培的高。由于植物对养分的要求因种类和生长发育的阶段而异，所以配方也要相应地改变，例如叶菜类需要较多的氮素（N），N可以促进叶片的生长；番茄、黄瓜要开花结果，比叶菜类需要较多的P，K，Ca，需要的N则比叶菜类少些。生长发育时期不同，植物对营养元素的需要也不一样。对苗期的番茄培养液里的N，P，K等元素可以少些；长大以后，就要增加其供应量。
