由于秸秆粉碎机转速高、负荷大，并且负荷的波动性较强，所以，秸秆粉碎机工作时的电流一般控制在额定电流的80—90%。秸秆粉碎机负荷的波动性取决于喂料量的稳定性。控制好粉碎机物料的水份，保证锤片质量并有良好的工作状态，再配以自动喂料控制系统和合理有效的辅助吸风系统，用以提高粉碎机的生产效率加工豆饼等较大物料时，须先用刀或锤将其加工成边长小于4cm的小块；地瓜藤、花生秧等要先用铡刀切成长度小于15cm的碎段，以防因喂入不均而造成超负荷工作。
轴承润滑不良；轴承损坏或主轴弯曲；转子不平衡；电机轴与秸秆粉碎机轴不平行，解决方法应该添加或者更换润滑脂。粉碎机工作时，操作人员不得擅离职守，应时刻观注机器的运转情况；操作人员应戴口罩、戴工作帽、扎紧衣袖，不得站立在转子的切线方向喂料器有手动、自动两种，自动喂料器有螺旋喂料器和叶轮喂料器。手动喂料器和螺旋喂料器安装合理，可以配套在小功率秸秆粉碎机上。
筛片磨损严重或有破洞；锤筛间隙过大等。排除方法是：打开秸秆粉碎机机盖，检查筛片有无损坏，锤筛间隙是否合适，连接件是否松动等。进料口反喷产生的原因：风门调节不当和输送管道堵塞或筛孔堵塞；集粉袋透气性差或长度不够。由于秸秆粉碎机转速高、负荷大，并且负荷的波动性较强，所以，秸秆粉碎机工作时的电流一般控制在额定电流的80—90%。秸秆粉碎机负荷的波动性取决于喂料量的稳定性。
轴承润滑不良；轴承损坏或主轴弯曲；转子不平衡；电机轴与秸秆粉碎机轴不平行，解决方法应该添加或者更换润滑脂。秸秆粉碎机运转的可靠性直接影响生产效率及后面工序的正常运行，因此，维修及操纵人员学会分析和处理秸秆粉碎机系统的常见机械故障，并在短期内予以排除电动机功率不足，转速过低或皮带打滑；锤片严重磨损或排列不符要求，锤片与筛面间隙过大或筛孔过小；喂料不均匀或原料含水量过高。
