机械清洗虽然比较方便，省时省力，单纯的机械清洗达不到理想的清洗效果。某些管道、精密仪器和较难清洗部位必须手工清洗，机械清洗不能全部代替手工清洗。研究结果表明，手工清洗结合机械清洗的效果优于单独手工清洗，超声波清洗和自动清洗机清洗。在实际工作中，只有将手工清洗和机械清洗有机结合起来，才能充分发挥清洗效果，提高器械的清洗质量。
手工清洗器械等物品，到底用啥清洗剂效果好呢？有文章报道，碱性清洗剂的手工清洗效果要好于多酶，也有文章报道说多酶清洗剂好于碱性清洗剂，众说纷云，这个问题在SIFIC论坛上引发了一场《手工清洗时碱性清洗剂一定比多酶清洗剂效果好吗？》大讨论，那么手工清洗到底应该怎么选择清洁剂呢？
清洗的目的是将污物带离物体表面，溶解或悬浮在清洁剂里，并通过漂洗彻底脱离复用器械。清洗是一个复杂的过程，清洁剂的选择也应该满足行业标准。
硬式内镜主要是金属材料构建，如腹腔镜、关节镜、镜、直肠镜等；内镜材质特殊，构造精密，管腔窦道多，不耐高温，高压，易腐蚀，且该类器械定期地暴露于有机质中，极易携带病原微生物。使用后的内镜未经恰当的清洗、消毒、灭菌处理，可能埋下隐患，导致患者的发生。
一、用后处理
内镜使用后立即用流动水彻底冲洗，除去血液、粘液等污染物；镜子道光束接头内光纤受污后及时清洗或擦干净(纱布、湿巾)，处理后将其分别放置于专用篮筐或容器内。避免与其他器械混装、防止因碰撞造成镜身损坏，影响成像。