无土栽培施用的是无机肥料，没有臭味，也不需要堆肥场地。常规土壤栽培施用有机肥，肥料分解发酵，产生臭味污染环境，还会使很多害虫的卵滋生，危害作物。无土栽培则不存在这些问题。室内种花，更要求清洁卫生，否则影响人们的生活质量。过去施用有机花肥，环境污染是个难以解决的问题，无土养花使问题迎刃而解。在现代化农业企业进行无土栽培时更省力省工、易于管理。无土栽培不需要中耕、翻地、锄草等作业，省力省工。
无土栽培还可以避免土壤连作障碍。常规土壤栽培中，特别是在设施栽培中，多年栽培同一种作物，土壤中往往会积累大量离子、土传病害等对植株***的物质，造成土壤养分平衡，发生连作障碍。耗工费力的“客土”方法虽能够解决连作障碍，但生产成本过大。而无土栽培，特别是采用水培，则从根本上解决了此问题。无土栽培还能够从根本上杜绝土传病害。
无土栽培使农业生产摆脱了自然环境的制约，使其可以按照人的意志进行生产，所以是一种受控农业的生产方式。较大程度地按数量化指标进行耕作，有利于实现机械化、自动化，从而逐步走向工业化的生产方式。目前在奥地利、荷兰、美国、日本等国的花卉生产中都实现了无土栽培及工厂化育苗，整个花卉生产就是一条工业流水线，较大程度上实现了农业现代化。
