通常情形下，人们根据功能上的差别，将低聚糖分为普通低聚糖和功能性低聚糖两大类，其中普通低聚糖（如蔗糖、麦芽糖、海藻糖、环糊精及麦芽寡糖等）能被机体消化吸收，产生能量，而功能性低聚糖不能被机体吸收，符合益生元的定义。促进双歧的增殖，提高机体的能力和抗病能力，促进动物的健康生长。改善畜禽水产品的品质，有着广阔的应用前景。 目前已开发成功的功能性低聚糖有果寡糖、大豆寡糖、半乳寡糖、异麦芽寡糖、木寡糖、甘露寡糖、壳寡糖、乳糖醇10余种。
大豆寡糖大豆寡糖是指大豆中所含有的寡糖类物质的总称，主要水苏糖（3.8%）、棉籽糖（1.1%）和蔗糖（5%）组成，同时还含有葡萄糖、果糖、半乳糖肌醇、D-肌醇（D-pinitole）等。 [4] 大豆寡糖的甜度为蔗糖的70%，能量仅为蔗糖的1/2，不易被动物消化吸收，对肠道有益菌具有增殖作用。
异麦芽寡糖异麦芽寡糖（α-gluccoligosaccharides，α-GOS），又称α-寡葡萄糖或分枝低聚糖，其中至少含有一个通过α-1，6-糖苷键结合的异麦芽糖，其他的葡萄糖分子可以通过α-1，2-糖苷键、α-1，4-糖苷键组成寡糖。其主要含有异麦芽糖、潘糖、异麦芽子糖、异麦芽四糖等。异麦芽寡糖产品有固体粉末和液体糖浆两大类。异麦芽寡糖可以改善动物肠道中的菌群结构，促进有益菌的增殖。经过长期的饲养试验证明异麦芽寡糖是一种安全性极高的甜味剂。
微藻中类胡萝卜素含量很高，具有着色和营养的作用，也可利用微藻为原料生产***、食用色素等食品添加剂或从中提取藻蓝素、叶绿素、虾青素、类胡萝I、素等食用色素。近年来，还从微藻中研究开发了EPA、DHA等多不饱和脂肪酸及多糖等***功能的食品添加剂。螺旋藻等一些微藻类益生元进入机体后可被选择性吸收，增加双歧数，增强机体能力。正因为如此，它已被联合国粮农***推荐为“21世纪人类理想的”。
调节脂肪代谢。益生元还可以影响脂肪代谢。对大鼠所做的实验表明，使用低聚木糖代替饲料中的糖后，病鼠胆固醇和甘油三酯下降。同样对于FOS做了实验，由实验结果可以看出降低。
益生元在体内被有益菌发酵生成短链脂肪酸，如醋酸、丙酸、丁酸、乳酸等，这些有机酸类物质能使肠道内pH值和氨的浓度降低，有效***肠道产物的生成， 并促进肠道蠕动而促进***，还可以改善脂质代谢。
