经过调查发现，引起效果不稳定有产品本身的问题，也有储运和用户使用的问题。因用户不正确使用，微生物肥料效果降低的现象十分常见，农户使用这类肥料存在诸多误区。
误区一：一个季节使用一次就可以，一次使用作用可持续多年。
部分微生物jun种施入土壤后会大量繁殖，当数量达到一定程度后就会成为优势菌群，但随着外部环境的改变，如化肥的超量使用、杀菌剂的使用、焖棚、高温等，都会导致有益菌死，从而影响有益菌群在土壤微生物系统中的地位。
要继续保持有益菌群的地位，就需要在作物的生长期多次使用微生物肥料来补充有益菌。
误区二：不注重菌的种类，认为一种菌可以解决多种问题。
少数用户在选购微生物肥料时，只注重是不是含菌，而不关注菌的种类，缺乏对症用菌的意识，使用了不对症的菌品种，产品效果难以发挥，难以达到用户目的。
现阶段在农业获得登记的微生物品种有根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合***菌剂、有机物料腐熟剂、促生菌剂、菌根菌剂、生物修复菌剂等，不同品种具有的功能也不同。
误区三：超过保质期使用就没有效果。
超过保质期并不意味着产品没有效果，要区别对待。
在实际应用中，也发现了一些特例，如荧光假单胞菌剂制品(液体)，超过保质期使用，其作用非但没有减效，而且较之前更突出，有待进一步研究。
适用作物：
瓜菜类、叶菜类、茄果类、根茎类、果树类、大田作物。
适用方法：
每亩使用本品1袋；土壤较贫瘠的可适量加大用量，可底施、冲施、穴施、沟施。
注意事项：
1、适用范围广，不受土壤、地域、作物品种的限制。
2、本品应于阴凉、干燥、通风处密封保存。
3、施用时请不要让肥料与根系直接接触，施用本品后应及时浇水。
微生物菌剂与微生物复合肥有何区别？
近年来，随着微生物菌肥的大火，农户们逐渐加深了对微生物菌的认知，知道施用微生物菌可以改良土壤，增加作物品质，然而，在农资市场还有一种微生物菌剂跟微生物菌肥只有一字之差，很多农户分辨不出两者的区别，那么，微生物菌肥与微生物菌剂有何区别？如何选择微生物菌肥呢？我们一起来看看吧！
微生物菌肥与微生物菌剂有何区别
什么是微生物菌肥
微生物肥料：微生物肥料即菌肥，大的特点就是以菌为本，含有特定微生物huo体的制品，通过其中所含微生物的生命活动，增加植物养分的供应量或促进植物生长，提高产量，改善农产品品质及农业生态环境。