与排水管相连的各个排水点均应设水封装置，水封深度不得小于50mm?。这是维持洁净室内各项技术指标的一个重要措施。需要净化工程的行业：印刷包装行业：精密技术印刷厂、高品质礼品包装、高品质烟酒、进口及高品质轿车等；古董库房：博物馆、古董房。近些年来，各大城市主要陆续新建、改建，增设或改造了原有的净化系统，这是我国经济发展、科技进步和医卫生水平提高的反映。
洁净厂房管道的内外壁应尽量光洁，管道及管件的接头处应有较好的平整度，以保证水流有较好的水力性能，以及降低微粒的沉积和微生物的繁殖。考虑到洁净厂房中的生产工艺技术发展迅速,产品升级换代快,生产工艺变化多等特点,在管道设计中应留有充分的余量。目前净化工程行业涉及如下：化学行业：实验室、铅酸蓄电池、电容器、无线充电技术等、电镀、塑料化工；生物制药：制药厂、无菌繁殖。
排水管材的选择，应针对排水的水质特点选用。洁净厂房内管道的敷设方式直接影响洁净室的空气洁净度，因此管道应尽量在洁净室外。给排水管道穿过洁净室墙壁、楼板和顶棚时，应设套管，套管内管段不得有接头，管道和套管之间必须用不起尘的密封材料封闭。洁净厂房除了合理的工艺布局，恰当的室内装修，配套的安装工程设计亦至关重要，给排水工程设计就是其中一个重要的环节。
