生物肥料的分类
(1)通过其中所含微生物的生命活动，增加了植物元素营养的供应量，包括土壤和生产环境中植物营养元素的供应总量和植物营养元素的有效供应量，促使植物营养状况的改善，进而产量增加，这一类微生物肥料的代表品种是根瘤菌肥料。
(2)其制品虽然也是通过其中所含的微生物生命活动的关键作用促使作物增产，但是其中微生物生 命活动的关键作用不限于提高植物的元素营养供应水平，包括了它们所产生的植物生长1刺激1素对植物的刺激作用，促进植物对营养元素的吸收作用，或者是有拮抗某些病原微生物的致病作用，减轻作物病虫害而导致产量增加。这类微生物的种类和制品比较多，也比较复杂。2）生物有机肥含有功能菌和有机质，能改良土壤促进被土壤固定养分的释放。但随着研究的深入发展，此类微生物及其制品将会有比较合理、比较科学的归属、分类。
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生物有机肥与化肥相比：
1） 生物有机肥营养元素齐全；化肥营养元素只有一种或几种。
2） 生物有机肥能够改良土壤；化肥经常使用会造成土壤板结。
3） 生物有机肥能提高产品品质；化肥施用过多导致产品品质低劣。
4） 生物有机肥能改善作物根际微生物群，提高植物的抗病虫能力；化肥则是作物微生物群体单一，易发生病虫害。
5） 生物有机肥能促进化肥的利用，提高化肥利用率；化肥单独使用易造成养分的固定和流失。
生物有机肥的使用方法
1.因地制宜推广应用不同的微生物菌肥料。如根瘤菌肥料应在豆科作物上广泛施用，解磷、解钾类微生物肥料应施用于养分潜力较高的土壤。
2.避免在高温干旱条件下使用。微生物肥料中的微生物在高温干旱条件下，生存和繁殖就会受到影响，不能发挥良好的作用。因此，应选择阴天或晴天的傍晚施用，并结合盖土、盖粪、浇水等措施，避免微生物肥料受阳光直射或因水分不足而难以发挥作用。