在众多的生物实验室，分子生物学检测方法如PCR因其高灵敏度、快速、操作方便等优势已经被广泛应用，不过正是由于它灵敏度极高，微量的污染源都有可能导致检测结果的假阳性，所以对环境污染的控制也极为严格。面对众多的污染源，比如样本交叉污染、***仪器交叉污染、质粒污染、PCR扩增产物污染、还有极容易忽视的气溶胶污染，气溶胶是由固体或液体小质点分散并悬浮在气体介质中形成的胶体分散体系，在空气与液体面摩擦时，比如在操作时比较剧烈地摇动反应管，开盖时、吸样时及污染进样枪的反复吸样都可形成气溶胶而污染。据计算一个气溶胶颗粒可含48000拷贝，因而由其造成的污染是一个非常重要而被忽视的污染源。
明确各实验室安全责任人，针对各个实验室的潜在危害张贴明显标志，对各种仪器设备的安全注意事项、使用规则明确告知，对药剂的危害、应急处理措施予以明确标注。要定期进行安全检查，开展安全学习和安全知识实验技术与管理竞赛，制定严格的奖惩措施，营造安全氛围。
通风橱是为在化学实验过程中清除腐蚀性化学气体和***烟雾而设计的。由于没有装备HEPA过滤器，通风橱不能有效清除微生物介质。放置在通风橱内微生物样品会散播到柜外，污染实验室环境。
首先从用电设施上说起，电源插座必须接地线，大功率仪器、电器设备必须接空气开关，实验室整个用电必须有漏电保护开关；
当可能发生交叉污染的两种操作必须在同一区域进行时，可以在时间上将两种操作分开。比如，由于实验室面积所限，必须在同一个无菌室中进行样品处理接种和菌的鉴定 工作，那么就只能将两种操作分别安排在上、下午，并在两种工作交接的时候对无菌室进行 彻底的消毒处理。这种对不同操作进行时间上隔离是一种“不得以而为之”的补救办法，在设计实验室的时候还是在空间上隔离可能存在交叉污染的不同操作。
