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那么，是什么因素决定了哪些微生物群可以和植物共存呢？换句话说，植物自身是否进化出了某些机制来维持特定的微生物群落种类和结构呢？这些是植物微生物群研究领域的重要科学问题。
根部是植物的水分和营养吸收的关键器1官，同时也是很多土壤病原菌侵染植物的主要部位，目前已有较多对根际微生物群的研究。这些研究发现根际微生物可以从多方面影响植物的生长和应对不同环境胁迫。例如一些水稻品种可以特异性富集土壤中的某些***，这些***会促进植物对氮元素的吸收和利用，从而促进植物生长。
随着洪水事件频繁发生，植物暴露于缺氧和根腐病菌滋生的环境下，容易造成不可避免的作物损失，特别是在土壤排水不良的地区。因此，提高豆类品种的水淹耐受性对于减少作物损失至关重要。
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