废水与活性污泥被膜隔开来，废水在膜内流动，而含某种专性***的活性污泥在膜外流动，废水与微生物不直接接触，有机污染物可以通过选择性透过膜被另一侧的微生物降解。由于萃取膜两侧的生物反应器单元和废水循环单元是各自***，各单元水流相互影响不大，生物反应器中营养物质和微生物生存条件不受废水水质的影响，使水处理效果稳定。系统的运行条件如HRT和SRT可分别控制在尤优的范围，维持尤大的污染物降解速率。
土地填埋场/肥渗滤液处理：土地填埋场/堆肥渗滤液含有高浓度的污染物，其水质和水量随气候条件与操作运行条件的变化而变化。 MBR技术在1994年前就被多家污水处理厂用于该种污水的处理。通过MBR与RO技术的结合，不仅能去除SS、有机物和氮，而且能有效去除盐类与***。美国Envirogen公司开发出一种MBR用于土地填埋场渗滤液的处理，并在新泽西建成一个日处理能力为40万加仑（约1500m3/d）的装置，在2000年底投入运行。该种MBR使用一种自然存在的混合菌来分解渗滤液中的烃和氯代化合物，其处理污染物的浓度为常规废水处理装置的50 ～ 100倍。能达到这一处理效果的原因是，MBR能够保留高有效***并使***浓度达到50000g/。在现场中试中，进液COD为几百至40000mg/L，污染物的去除率达90%以上。
2、种泥的投加：必须进行种泥的投加。如果不进行种泥投加，直接用膜分离原水，可能较早地产生膜的堵塞。请按以下要点实施种泥的投加。(1)请预备好处理同种废水的种泥。推荐采用MLSS浓度在20,000mg/L左右的种泥。(2)投加种泥后紧接着开始投入原水。请通过微细格栅(缝隙5m以下)等来投入，从而去除夹杂的物质。(3)种泥投入的童应能使膜浸没槽ILSS浓度在7, 000mg/L以上。*请勿使用接种剂。
3、运转开始：种泥投加完毕后，首先开始曝气，接着开始过滤运行，同时开始原水供给。过滤水里稳定时，请测定、记录下实际运行的过滤水量下的膜间压差、水温。
膜组件的取出：取出膜组件时，请按以下顺序操作。(1)将膜生物反应器内的活性污泥全部排出。(2)仅取出膜元件区时，请取下集水管配管。若曝气区也需要取出时，请也取下曝气管配管。(3)仅取出膜元件区时，请卸下曝气管区的联结螺拴。这样才能取出膜元件区。对于TMR140- -200W而言，如果集水管连接到两个膜元件箱，卸下螺栓取下集水管。(4)若曝气区也需要取出时，请卸下固定锚。这样才能取出曝气区。