过酸或过碱的土壤
土壤偏酸或偏碱都不利于菌的生长繁殖，可能微生物肥中的菌都会被杀si，其实土壤酸碱值在6.5-7.5之间时适合生物菌的繁殖，只要让土壤酸碱值达到6.5-7.5，就能保证生物菌大量繁殖，不过我们还要参考作物适宜的酸碱度去种植。
与农要化肥同时施用
有时我们种植的作物会出现根系发育不良等现象，我们可能会施用微生物菌剂也可能会施用化肥等帮助作物正常生长。但是为了防止活菌被杀si，微生物菌剂是万万不能和杀菌剂、高浓度肥料溶液混用，另外jun种繁殖需要中性或者弱酸性的环境，所以也不能和强碱性的草木灰混用。因为这些很容易杀si微生物菌。在施用时如果我们施用的微生物菌剂与防病虫、除草相矛盾时，好等到药剂持效期后再用微生物菌剂。
微生物有机肥料含有有机物质，不仅可提供作物生长所要的各类营养物质，而且能改善土壤的结构、增强土壤保水保肥能力。有机质分解后产生腐殖酸、***、生素和各种酶，改善了作物根系的营养环境，促进了作物根系及地上部分的生长发育，提高了作物对养分的吸收能力。有机质分解所产生的有机酸还可提高土壤中微量元素的有效性。
“菌美多?微生物菌剂”是北京京农克奥生物科技有限公司研制开发的一种高活性高浓度微生物菌剂。有益活性菌群高，有机载体营养足，能够解除土壤板结，改良修复土壤。适用于柑橘、柚子、脐橙、苹果、葡萄、大樱桃、梨、桃等果树，大蒜，大姜，土豆、蔬菜、瓜果、花卉、***等以及其他大田作物。
微生物菌剂与微生物菌肥的区别：
菌剂是农用微生物菌剂的简称，对应的标准是《农用微生物菌剂》（即微生物接种剂）（GB 20287-2006），是指1种或1种以上的目标微生物经工业化生产扩繁后直接使用或仅与利于该培养物存活的载体吸附所形成的活提制品，它是菌肥大类的其中一种。国标功能菌的含量为2亿/克，这是微生物肥料类中功能菌含量高的一种，是少量使用的。主要用途是与其他畜禽粪便、植物秸秆及其他动植物残体一起施用，或者发酵起到腐熟和补充有益功能菌的作用。菌剂一般包装小，2-5公斤，亩用量也是2-10公斤就可以了。
根际微生物环境的变化
根际是指受植物根系活动影响，在物理、化学和生物学性质上不同于土体的那部分微域土区。而与土壤差别明显的就是pH值、微生物活性变化等。
根际微生物是指在植物根系直接影响的土壤范围内生长繁殖的微生物。可以将有机物转变为无机物，为植物提供养料；同时还能分泌***，生zhang刺激俗等，促进植物生长。
土壤中酸离子浓度增加，会影响根部微生态环境变化，造成微生物生存环境恶化，分解有机物和分泌物质的能力下降，使根部营养不良，影响植物的生长。