在进行化粪池清理的时候，化粪池内部会有大量的气体。这些都是在进行粪便处理的时候会产生的气体，而这些气体对于人来说会有一定的危害，我们在进行化粪池清理的时候就一定要做好保护措施。以防在进行化粪池清理的时候受到不必要的危害，所以我们在进行清理工作的时候保护措施的确定是十分重要的。在进化粪池清理工作的时候还需要对管道连接的部分进行注意，在清理的时候要避免造成化粪池出现破损的情况。而且在清理的时候会将化粪池中原有的粪便搬运走，在进行搬运工作的时候对于位置和运输的过程都是要十分注意的，以防造成环境的污染。
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主要截留含虫卵较多的粪便，粪便经发酵分解，松散的粪块因发酵膨胀而浮升，比重大的下沉，因而形成上浮的粪皮、中层的粪液和下沉的粪渣。利用的比重大于粪尿混合液的原理使其自然沉降于化粪池底部。利用粪液的浸泡和翻动化解粪块使其液化并截留粪渣于池底。厌氧发酵：化粪池的密闭厌氧环境，可以分解蛋白性有机物，并产生氨等物质，这些物质具有杀灭卵及病菌的作用。
便器、盖板、清渣口、出粪口便器一般可采用节水型便器。可以是坐便器也可以是蹲便器。格化粪池盖顶留有进粪口和清渣口，进粪口上安装便器，进粪管可采用内径为150mm的PVC塑料或其它管材，要尽量远离过粪口，并紧贴池壁，以减少水冲力对池内的扰动。在安装便器时可不用水泥固定死，进粪口也可作为清渣口。用防溅式直器和水封便器则不必下接进粪管第二池顶应密封，但也要留有清渣口，第三池盖顶留有出粪口，出粪口用盖密封。
为什么需要定期清理化粪池
管理者和市民意识到进入化粪池的粪便会“融化”,不知道化粪池中约有40%的消化污泥需要定期清除；对化粪池的隐患缺乏认识。除了污染环境及对污水排放造成压力外，更会造成沼气爆1炸，对市民造成伤害。目前，化粪池的建设需要经过环卫部门的批准，但建成后的管理问题是真空的；客观上保持化粪池的处置能力。