常见的水中粪大肠菌群检测方法如下：
1、多管发酵法
通过将污染水样接种入多根试管中进行恒温培养，利用大肠菌群繁殖时使乳糖发酵，并能使乳糖蛋白胨培养液变黄，同时产生气泡的特有现象，根据不同接种量的发酵管所表现阳性结果的数目，从MPN表中查的相应的MPN指数，计算每升水中粪大肠菌群的***近似值。
2、滤膜法
将水样注入已灭菌的放有孔径为0.45μm滤膜的滤器中，经过抽滤，将***截留在膜上，然后将滤膜贴于M-FC培养基上，经44.5℃温度下进行培养，计数培养基上呈蓝色或蓝绿色的菌落，计算出每升水的粪大肠菌数。
作为粪便污染的指示菌，大肠埃希氏菌检出的意义大，其次是粪大肠菌群，总大肠菌群的检出意义略差一些， 固定底物技术酶底物法操作简便，检测时间短，可在24小时内同时检测水中大肠菌群和大肠埃希氏菌的污染状况且无需确认试验；减少了传统方法中人为操作的误差，能够更准确地判断水样的微生物污染状况；作为***饮用水卫生标准的新方法，不但可以用于水样的例行检测，更可作为应急突发事件的必备***。
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***饮用水标准规定，饮用水中大肠菌群数不超过3CFU/L，***总数不超过100CFU/mL。2005年6月开始，城市供水卫生标准有所提高，自来水中***菌落数不得超过80CFU/mL，任意取100mL水样不得检出大肠***。因此，对水中的***数量及大肠菌群数的检验是保证饮用水安全和控制传ran病的有效手段，同时也是评价水质状况的重要指标。
