2004年8月16日，国务院办公厅批复海关总署，同意在深圳盐田港等七个保税区与各自临近港区开展联动试点，成立盐田港保税物流园。2005年12月31日，盐田港保税区物流园通过国家联合验收组的验收，2006年3月28日,盐田港保税物流园区正式封关运作。盐田港保税物流园区实行区港联动，具有入区退税的功能，无需等到货物实际离港就可实现退税功能。且距离盐田港较近，是出口拼柜，进口拆柜分拨的首选之地。
一般贸易企业货物出口至盐田港保税物流园区能实现退税功能；进料加工企业的货物入盐田港保税物流园区能实现手册核销，入区退税；来料加工企业的货物入盐田保税物流园区能实现手册核销；无进出口权的企业能买单出口（不需商检的产品）至保税物流园，保税仓库能实现将这四种性质的企业货物拼成一个柜子发给指定的国外客户及目的地，免除国外清关手续的繁烦。
针对原材料及半成品需要做进口分拨的情况，货物从境外运至盐田港，以区港联动的优势，将整柜提至盐田保税仓库，根据大陆工厂的需要进行分拨配送，可以手册加工进口，也可以一般贸易缴税进口，满足不同的客户需求。