因为小龙虾落沟就意味着养殖户要开始种稻了，只有沟里还保留着一部分水让小龙虾生存，因此小龙虾的生存面积就大大减少，沟里虾的密度大，水体又不易流动，进而导致水质容易恶化。虾沟常见的水质问题有：浑水、铁锈水、蓝藻水、浓绿水。
其次，很多养殖户在小龙虾落沟后就不再给虾投喂饲料了，而围沟里又没有草，由此可能会导致小龙虾缺食而自相残杀。还有，很多养殖户认为今年留的虾多一些，明年出的虾苗就多，因此虾沟里面还有很多大虾就留着不起，这种想法也是不恰当的。围沟里小龙虾密度大，不仅容易坏水质，而且小龙虾会出现长势慢、容易缺食等问题，而且这个时候正是小龙虾价格较好的时候，可以起一部分大虾卖了，这样不仅可以提升养殖效益，又控制了虾沟里小龙虾的密度，两全其美，何乐不为。养殖户如果不对虾沟里的小龙虾进行科学管理，即使小龙虾能够存活下来，但是由于环境恶劣，会使小龙虾性成熟提前，影响种虾的怀卵数量和质量。所以虾田后期的管理工作是非常必要的。
?合理投放、轮捕轮放，是小龙虾养殖提高产量的有效手段
合理投放、轮捕轮放，是稻田养虾提高产量的有效手段，
6、7月初投放的幼虾规格不一定是一致的，没有达到上市规格的虾也可以投放，待水稻栽插1 5天～20天时，投放幼虾，放种量一般在30kg／亩左右。第壹次放10kg左右观察几天再投放第二批，幼虾来源尽量就地收购，随收随放，尽量缩短收放时间，提高幼虾成活率。
投放幼虾时要对整个田块均匀分布，三分之一投放到环形沟中，三分之二投放到稻田中，直接投放在稻田中的龙虾不会夹苗而影响水稻的生长，龙虾这时所夹水草只是稻田中刚冒出的杂草嫩芽。由于龙虾有较强的地盘性，均匀分布投放，才能有效利用稻田的浅水环境。
养殖龙虾必须根据生长情况即时轮捕轮放，6月中旬所放的幼虾在7月中旬就可以捕捞，根据捕捞情况还可以适当再补充虾苗。
稻田种、养殖的田间管理，龙虾和水稻都有一段时间的混作，它涉及稻田的施肥、除草、排灌、收割、防治1病虫害等。同时也涉及到龙虾养殖的投喂、水质控制、防逃、防敌害、防病治1病和捕捞等。因此，龙虾和水稻交叉种养殖是一项技术性比较强的工作。要种好稻，养好虾，必须在物质、技术条件具备情况下，才能上马投产。
由于小龙虾具有自然繁殖的习性，渝中区小龙虾种苗，所以绝大多数养殖户采取的都是一年放种，多年养成的养殖模式，这就必然导致龙虾之间存在近亲繁殖的问题，***终导致龙虾种质退化，个体越来越小，并且在养殖过程中又都有捕大留 小的问题，等到每年9月份前后选留亲虾的时候，小龙虾种苗养殖技术，大规格的龙虾早已卖光，小龙虾种苗价格，所以只有把那些较小的龙虾留作下一年的亲虾用，这样的亲虾本身就差，小龙虾种苗养殖，其繁殖的下一代的品质就更难以得到保证。
建议养殖户要每隔3年彻底清一次塘，将塘中所有的龙虾全部清光一只不留，下一年更换新的亲虾，或者在每年的9月份前后从其他地方的养殖户那里引进一定数量的大规格龙虾作为亲虾，注意：在引进亲虾的时候在同一个地方只需引进一种性别的亲虾就可以了，如果在同一个地方同时引进雌雄两种亲虾的话，这可能存在近亲繁殖的问题。亲虾选择要求附肢齐全，体质健壮，无病无伤，活动能力强，体重30-50g/只左右。
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